qPCR
qPCR-techniek voor aaltjes
Bij het onderzoeken van aaltjes is het van groot belang om nauwkeurig en efficiënt te kunnen vaststellen welke soorten aanwezig zijn en in welke hoeveelheden. De DNA-analyse, uitgevoerd met de qPCR-techniek (kwantitatieve polymerasekettingreactie), biedt hiervoor een geavanceerde oplossing. Deze techniek maakt gebruik van de unieke genetische eigenschappen van aaltjes om hun aanwezigheid en aantal in een monster nauwkeurig te bepalen.
Hoe werkt de qPCR-techniek?
De qPCR-techniek is een geavanceerde methode die het mogelijk maakt om een kleine hoeveelheid specifiek DNA, afkomstig van een bepaald aaltje, in korte tijd te vermenigvuldigen. Het proces begint met het isoleren van het doel-DNA uit een monster, waarbij het DNA van het gewenste aaltje wordt geïdentificeerd. Vervolgens wordt dit DNA via een kettingreactie exponentieel gekopieerd. Dit betekent dat de hoeveelheid DNA in elke cyclus van de reactie verdubbelt. Zo wordt de hoeveelheid doel-DNA snel meer.
Dit groeiende DNA-signaal wordt vervolgens zichtbaar gemaakt, meestal door fluorescentie, waardoor gevolg kan worden hoe het DNA toeneemt. Door deze gegevens te vergelijken met vooraf opgestelde ijklijnen, kan nauwkeurig worden berekend hoeveel aaltjes oorspronkelijk in het monster aanwezig waren.
De DNA-analyse wordt alleen toegepast op levend aaltjesmateriaal. Dit betekent dat alleen de aaltjes die actief door een filter zijn gekropen, worden geanalyseerd. Dit proces garandeert dat de DNA-analyse zich richt op aaltjes die daadwerkelijk in staat zijn om schade aan gewassen te veroorzaken.
Voordelen
De kracht van qPCR in het aaltjesonderzoek ligt in de combinatie van nauwkeurigheid en specificiteit. De techniek kan zelfs zeer kleine hoeveelheden DNA detecteren, wat betekent dat ook aaltjes die in lage aantallen voorkomen betrouwbaar worden geïdentificeerd.